Jalur kereta api Cirebon – Jakarta dihubungkan oleh 2 kereta api, yakni New KA Argo Jati yang merupakan kereta api kelas eksekutif argo serta KA Cirebon Ekspres yang merupakan KA kelas Eksekutif & Bisnis. KA New Argo Jati dioperasikan oleh Daop 3 Cirebon dari stasiun Gambir Jakarta (GMR) menuju ke stasiun Cirebon (CN), dan untuk rute sebaliknya.
KA New Argo Jati baru dioperasikan pada 3 November 2010 sebagai pengganti rangkaian kereta api Argo Jati. Rangkaian kereta ini masih menggunakan bekas rangkaian kereta api Argo Jati yang telah dihapus jadwal pengoperasiannya. Rangkaian KA New Argo Jati berisi 6 gerbong kereta Kelas Eksekutif (K1 CN), 1 gerbong kereta Bagasi Cargo (B SBI), 1 gerbong kereta Makan Restorasi Bermotif Batik (KM1 dan M1 CN), serta 1 gerbong kereta Pembangkit (P CN).
Berikut Jadwal Keberangkatan untuk KA New Argo Jati sesuai aturan Gapeka 2015 :
| KA Argo Jati (15) rute Cirebon – Gambir | KA Argo Jati (16) rute Gambir – Cirebon | ||||
| Stasiun | Kedatangan | Keberangkatan | Stasiun | Kedatangan | Keberangkatan |
| Cirebon | – | 05.45 | Gambir | – | 09.10 |
| Jatibarang | 06.14 | 06.16 | Jatibarang | 11.21 | 11.23 |
| Jatinegara | 08.22 | 08.25 | Cirebon | 11.55 | – |
| Gambir | 08.36 | – | |||
| KA Argo Jati (17) rute Cirebon – Gambir | KA Argo Jati (18) rute Gambir – Cirebon | ||||
| Stasiun | Kedatangan | Keberangkatan | Stasiun | Kedatangan | Keberangkatan |
| Cirebon | – | 14.00 | Gambir | – | 17.15 |
| Jatibarang | 14.29 | 14.31 | Jatibarang | 19.26 | 19.28 |
| Jatinegara | 16.34 | 16.36 | Cirebon | 19.58 | – |
| Gambir | 16.48 | – | |||
| KA Argo Jati Fakultatif (39F) rute Cirebon – Gambir | KA Argo Jati Fakultatif (40F) rute Gambir – Cirebon | ||||
| Stasiun | Kedatangan | Keberangkatan | Stasiun | Kedatangan | Keberangkatan |
| Cirebon | – | 12.30 | Gambir | – | 07.30 |
| Gambir | 15.22 | – | Cirebon | 10.18 | – |
Kereta api selanjutnya adalah KA Cirebon Ekspres, yang dioperasikan oleh PT KAI Daop 3 Cirebon untuk koridor Gambir-Cirebon. Dalam perjalanannya, kereta ini menempuh jarak sejauh 219 km dalam waktu 3 jam perjalanan. KA Cirebon Ekspres hanya singgah di 1 stasiun Jatibarang.
Untuk jadwal keberangkatan dan kedatangan KA Cirebon Ekspres adalah sebagai berikut :
| KA Cirebon Ekspres (61) rute Cirebon – Gambir | KA Cirebon Ekspres (62) rute Gambir – Cirebon | ||||
| Stasiun | Kedatangan | Keberangkatan | Stasiun | Kedatangan | Keberangkatan |
| Cirebon | – | 06.15 | Gambir | – | 06.00 |
| Jatibarang | 06.48 | 06.51 | Jatibarang | 08.29 | 08.31 |
| Haurgeulis | 07.25 | 07.27 | Cirebon | 09.04 | – |
| Jatinegara | 09.12 | 09.14 | |||
| Gambir | 09.25 | – | |||
| KA Cirebon Ekspres (65) rute Cirebon – Gambir | KA Cirebon Ekspres (64) rute Gambir – Cirebon | ||||
| Stasiun | Kedatangan | Keberangkatan | Stasiun | Kedatangan | Keberangkatan |
| Cirebon | – | 10.00 | Gambir | – | 10.00 |
| Jatibarang | 10.32 | 10.34 | Haurgeulis | 11.53 | 11.55 |
| Jatinegara | 12.49 | 12.51 | Jatibarang | 12.29 | 12.31 |
| Gambir | 13.02 | – | Cirebon | 13.04 | – |
| KA Cirebon Ekspres (67) rute Cirebon – Gambir | KA Cirebon Ekspres (68) rute Gambir – Cirebon | ||||
| Stasiun | Kedatangan | Keberangkatan | Stasiun | Kedatangan | Keberangkatan |
| Cirebon | – | 15.15 | Gambir | – | 13.45 |
| Jatibarang | 15.47 | 15.49 | Jatibarang | 16.09 | 16.11 |
| Jatinegara | 18.00 | 18.02 | Arjawinangun | 16.30 | 16.32 |
| Gambir | 18.12 | – | Cirebon | 16.48 | – |
