Stasiun Wates (WT) adalah sebuah stasiun kereta api yang berada di wilayah Daop VI Yogyakarta, tepatnya berlokasi di Kecamatan Wates, Kabupaten Kulonprogo, D.I. Yogyakarta. Stasiun Wates berdiri di ketinggian +18 mdpl ini berada di dekat Alun-alun Wates, serta diapit oleh 2 stasiun yang kini telah berstatus non aktif, yakni Stasiun Kedundang dan Stasiun Kalimenur.
Stasiun Wates memiliki 5 jalur yang semuanya masih digunakan hingga saat ini. Jalur 1 digunakan untuk jalur perjalanan langsung dari arah barat, Jalur 2 untuk perjalanan langsung KA dari arah timur, dan Jalur 3 untuk pemberhentian kereta api baik dari arah timur maupun barat. Sementara untuk jalur 4 dan 5 digunakan untuk stabling rangkaian gerbong ataupun bongkar muat batu balast (kricak).
Sebagai satu-satunya stasiun kereta api di Kulonprogo, Stasiun Wates menjadi andalan masyarakat setempat yang hendak menggunakan jasa angkutan kereta api kelas ekonomi hingga eksekutif. Beberapa kereta api yang singgah di Stasiun Wates diantaranya adalah KA Lodaya, KA Gajah Wong, KA Bogowonto, KA Senja Utama Yogya, KA Fajar Utama Yogya, KA Prambanan Ekspres, KA Progo, KA Kahuripan, KA Krakatau, KA Bengawan, KA Logawa, dan KA Jaka Tingkir.
Berikut selengkapnya, jadwal kereta api yang singgah di Stasiun Wates sesuai Gapeka 2015,
| Nama & No. KA | Kelas | Tujuan | Tiba | Berangkat |
| Lodaya (82) | Eksekutif & Bisnis | Solo Balapan (SLO) | 02.29 | 02.31 |
| Senja Utama Yogya (138) | Bisnis | Yogyakarta Tugu (YK) | 02.47 | 02.49 |
| Kahuripan (182) | Ekonomi | Kediri (KD) | 04.10 | 04.12 |
| Bogowonto (162) | Ekonomi | Yogyakarta Lempuyangan (LPN) | 05.19 | 05.21 |
| Progo (186) | Ekonomi | Yogya Lempuyangan (LPN) | 06.16 | 06.22 |
| Fajar Utama Yogya (135) | Bisnis | Jakarta Pasar Senen (PSE) | 07.27 | 07.30 |
| Logawa (188) | Ekonomi | Jember (JR) | 08.10 | 08.12 |
| Lodaya (79) | Eksekutif & Bisnis | Bandung (BD) | 08.10 | 08.12 |
| Bogowonto (161) | Ekonomi | Jakarta Pasar Senen (PSE) | 09.34 | 09.36 |
| Krakatau (165) | Ekonomi | Merak (MER) | 13.13 | 13.16 |
| Pasundan (180) | Ekonomi | Surabaya Gubeng (SGU) | 13.37 | 13.40 |
| Fajar Utama Yogya (136) | Bisnis | Yogyakarta Tugu (YK) | 14.10 | 14.13 |
| Pasundan (179) | Ekonomi | Bandung Kiaracondong (KAC) | 14.31 | 14.34 |
| Lodaya (80) | Eksekutif & Bisnis | Solo Balapan (SLO) | 14.43 | 14.45 |
| Gajah Wong (164) | Ekonomi | Yogyakarta Lempuyangan (LPN) | 14.55 | 15.01 |
| Progo (185) | Ekonomi | Jakarta Pasar Senen (PSE) | 15.01 | 15.04 |
| Logawa (190) | Ekonomi | Purwokerto (PWT) | 15.26 | 15.28 |
| Bengawan (183) | Ekonomi | Jakarta Pasar Senen (PSE) | 16.01 | 16.05 |
| Gaya Baru Malam Selatan (173) | Ekonomi | Jakarta Pasar Senen (PSE) | 17.40 | 17.42 |
| Senja Utama Yogya (137) | Bisnis | Jakarta Pasar Senen (PSE) | 18.13 | 18.17 |
| Gajah Wong (163) | Ekonomi | Jakarta Pasar Senen (PSE) | 18.35 | 18.38 |
| Gaya Baru Malam Selatan (174) | Ekonomi | Surabaya Gubeng (SGU) | 18.48 | 18.51 |
| Bengawan (184) | Ekonomi | Solo Purwosari (PWS | 19.18 | 19.20 |
| Kahuripan (181) | Ekonomi | Bandung Kiaracondong (KAC) | 19.27 | 19.29 |
| Jaka Tingkir (156) | Ekonomi | Solo Purwosari (PWS | 20.22 | 20.26 |
| Lodaya (81) | Eksekutif & Bisnis | Bandung Hall (BD) | 20.35 | 20.37 |
| Krakatau (166) | Ekonomi | Kediri (KD) | 21.20 | 21.23 |
