Stasiun Kebasen adalah salah satu stasiun kereta api kecil yang terletak di lintas Kroya-Purwokerto-Cirebon. Stasiun ini terletak di dekat bendung gerak (irigasi) Gambarsari di tepian Sungai Serayu dan dekat terowongan kereta api Kebasen. Stasiun Kebasen termasuk dalam wilayah Kec. Kebasen, Banyumas.
Dahulu, stasiun yang terletak di ketinggian 14 m dpl ini mempunyai percabangan menuju Stasiun Purwokerto Timur dan Stasiun Maos. Sayangnya, jalurnya sudah dibongkar oleh tentara Jepang pada masa pendudukan Jepang.
Seperti halnya Stasiun Notog, Stasiun Kebasen juga tidak menaikturunkan penumpang. Stasiun ini hanya melayani persilangan kereta api.
Meski hanya melayani persilangan, stasiun ini merupakan bagian jalur utama yang menghubungkan jalur rel kereta api lintas utara Pulau Jawa (dari Cirebon) dengan jalur kereta api lintas selatan (dari Kroya). Saat ini, jalur yang ada di stasiun tersebut tengah ditingkatkan dari jalur rel tunggal menjadi jalur rel ganda untuk mendukung semakin meningkatnya frekuensi lalulintas kereta api yang lewat. Stasiun ini berada di bawah pengendalian PT KAI Daerah Operasi (Daop) V Purwokerto.
Stasiun Kebasen terletak di jalur kereta api yang menembus daerah pegunungan (di antara Pegunungan Pembarisan di sisi barat dan kaki Gunung Slamet di sisi timur) dengan jalur yang berliku-liku dan pemandangan yang menarik. Tanjakan yang cukup terjal membuat beberapa rangkaian panjang atau berat memerlukan traksi ganda (loko dobel) untuk memudahkan pergerakan.
Antara Stasiun Kebasen dan Notog, jalur rel akan menembus dua terowongan kereta api, yakni Terowongan Notog (260 m) dan Terowongan Kebasen (79 m), serta melintasi jembatan panjang yang menyeberangi Kali Serayu. Kedua terowongan lengkung itu dibangun pada tahun 1915 oleh perusahaan kereta api Hindia Belanda, Staatsspoorwegen (SS).
Khusus untuk Terowongan Kebasen, terowongan ini cukup unik karena selain hanya memiliki panjang 79 meter, terowongan ini berada di bawah lintasan jalan raya. Adapun jalan raya yang berada di atasnya menghubungkan Purwokerto-Kebasen-Sampang.
Beberapa kereta api yang melintasi stasiun ini adalah:
- Progo tujuan Pasar Senen Jakarta
- Kutajaya Utara tujuan Kutoarjo
- Senja Utama Yogya ke Yogyakarta
- Bogowonto ke Pasar Senen
- Sawunggalih Utama
- Argo Lawu
- Taksaka
- Puwojaya
- Argo Dwipangga
